Basepairのご利用について
このページでは、Basepairのご利用について、よくご質問いただく内容についてまとめました。
アカウント発行について
はじめにアカウントを作成していただきます。ウェブサイトの右上のSign up、もしくは下のボタンからアカウント作成画面に入ることができますので、アカウントを作成してください。
フリートライアルについて
新規にアカウントを作成すると自動的に6サンプル分のフリートライアルが付与されます。
- 「所属研究室ごと」といった概念はなく、個別のアカウントに対して付与されます。
- フリートライアルでは、解析の制限はありません。WGSでもシングルセルでも6サンプル分のお試しが可能です。
- アップロードされたデータに対する解析数の制限もありません。
シェアについて
Basepairならチームメンバーやコラボレーターとの共有も簡単に行えます。共有された方の課金はありません（アカウント作成は必要です）。
権限設定には、閲覧のみから管理者権限まであります。
- View：ユーザーは選択したプロジェクトの表示、プロジェクトのサンプルと分析の表示、および関連ファイルのダウンロードが可能になります。
- Edit：ユーザーは選択したプロジェクトの情報の編集、プロジェクトへのサンプルの追加、プロジェクト内のサンプルの分析の実行、プロジェクトのサンプルと分析の編集を行うことができます。
- Admin：ユーザーは、選択したプロジェクトのサンプルと分析を他のプロジェクトに移動したり、選択したプロジェクトを他のユーザーと共有したり、プロジェクトを削除したりすることができます。（プロジェクトのサンプルと分析のいずれか）
紹介機能について
新しくひとり招待するごとに、追加で3サンプルの無料分を獲得できます。
他の研究者の方をご紹介いただくことができます。ログイン状態の画面で、上部右側に「REFER A COLLEAGUE」というメニューがあります。こちらをクリックすると、紹介する相手へのメッセージダイアログボックスが開きますので、メールアドレス、メッセージを入力し、送信ボタンを押せば完了です。日本語での入力も可能です。
アプリケーション
一般的なNGSアプリケーションに対するパイプラインは実装済みです。詳しくはログイン後に[PIPELINE]メニューからご確認ください。カスタムパイプラインの構築やすでに開発済みのパイプラインの組み込みも対応可能です（別途費用が発生します）。
- WGS/WES
- Panel
- RNA-Seq
- ChIP-Seq
- ATAC-Seq
- シングルセルRNA-Seq
アップロードできるファイルフォーマット
ab1, .bam, .csfasta, .csv, .fastq, .fq, .gpr, .gvcf, .qual, .vcf, .sam, .sra, .tsv, .txt, .bz, .bz2, .gz
対応シーケンシングプラットフォーム
Illumina / PacBio / Ion Torrent / SOLiD
課金について
課金は2タイプあります。サンプル数や目的に合わせてご検討ください。
PAYG（Pay As You Go：従量課金モデル）
サンプル数に応じた従量課金モデルです。フリートライアル終了後にお使い続けられる場合は、必要なサンプル数に応じたクーポンを発行します。アプリケーション、サンプル数をお知らせください。お見積もりを発行します。発注書をいただいた後、ユーザーに直接メールでクーポンコードを発行します。同じタイミングで納品、請求書を発行します。
Annual License
サンプル数が多い、カスタマイズが必要、独自のパイプラインを組み込みたいなどの場合や、自社ブランドでの展開などカスタマイズが可能なモデルです。自社のクラウドサーバーにすでにデータがある場合はクラウド上での連携も可能です。自社のクラウドサーバーと連携する場合は、利用料をグッと抑えることができます。設定、実装などに別途費用が発生します。
ガイダンスページ
その他、データのアップロード方法など基本的な使い方をまとめていますので、併せてご参照ください。