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AWS での NGS データ分析の操作: シーケンシングを初めて行うライフ サイエンス組織のための重要な考慮事項
はじめに 新しいシーケンス機器への投資おめでとうございます! あなたはゲノミクスの広大な世界に隠された秘密を解き明かす鍵を握っています。 しかし、この取り組みはデータ生成で終わるわけではありません。 そこから始 […] -
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ChIP-seqデータのパスウェイエンリッチメント解析
すでにご存知かもしれませんが、BasepairはChIP-seq解析のための非常に人気のあるツールを多数提供しており、FASTQファイルをシームレスに有意義な結果へと導きます。約1時間で、トリミング、アライメントから、ピ […] -
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GATKパイプラインで塩基品質スコア再キャリブレーション（Base quality score recalibration、BQSR）を行う必要がありますか？既知部位のvcfファイルがない場合、どのように行うべきでしょうか？
(a) 残念なことに、次世代シーケンサーによって生成される品質スコアは、様々な系統的技術的エラーの原因となり、データ中の塩基の品質スコアの過大評価または過小評価につながります。これらのエラーは、シーケンス反応の物理的また […] -
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ユーザーフレンドリーなNGS解析ソフトウェア「Basepair」による胚選択と体外受精成功率の向上
IVF（In vitro fertilization、体外受精）を専門とする先駆的な医療機器メーカーのひとつが、岐路に立たされていました。同社はすでに数十億ドル規模の機器、アッセイ、培養液のポートフォリオを有していたが、 […] -
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数百サンプルの大規模プロジェクトに最適な完全自動アップロードオプション
Basepairには、多くのユーザーにとって理想的な使いやすいアップロードページがあります。ローカルコンピューターからアップロードしたいサンプルを選択し、サンプルのメタデータを指定し、アップロードを開始します。インターネ […]
