For Bioinformatics Cores

ベンチサイエンティストとバイオインフォマティシャンのコラボレーションを加速する

Basepair は BaseSpace よりもはるかに使いやすいです。 クリックしてドラッグして FASTQ ファイルをアップロードし、パイプラインを選択するだけで、自動的に作業が行われます。 分析後、主任研究者に提供できる美しい数値が提示されます。 これにより、分析がほぼ手作業で行えるようになりました。

アンドリュー・ヒルハウス
アソシエイトディレクター テキサス A&M ゲノム科学社会研究所 (TIGSS)

ベンチサイエンティストとバイオインフォマティシャン間のコラボレーションを加速する

シングルセルRNA-seq などの最先端のデータ タイプが科学コミュニティ内で普及するにつれて、バイオインフォマティクスのコアは計算が複雑なプロジェクトに忙殺されています。 ここでは、画一的なパイプラインは機能しません。分析には繊細な微調整が必​​要です。 各プロジェクトは ユニークであり、バイオインフォマティシャンはベンチサイエンティストと一緒に生物学を深く掘り下げる必要があります。

Basepairを使用すると、バイオインフォマティシャンはカスタムパイプラインを実行し、ユーザーフレンドリーな GUI を介して結果を顧客と直接共有できます。 これは、あなたとあなたの依頼主がデータの解釈により多くの時間を費やすことができることを意味します。

やり取りのメールは不要になります

10個ではなく5個のクラスターを含むt-SNEプロットを生成するには、何通の電子メールが必要ですか? Basepairで分析を実行すると、そのようなやり取りは必要なくなります。数字を正確に把握するためだけにメールを送り続けるのは、非効率的で煩わしく、拡張性がありません。

依頼主は美しいグラフや図を含むインタラクティブなレポートにアクセスできるようになります。 品質管理メトリクスから、t-SNE および UMAP クラスター、ヒートマップまですぐに出版できる図を数秒で作成してダウンロードできます。

すべてのステップでパイプラインと分析結果を制御

Basepair を使用すると、バイオインフォマティシャンによって完全に制御された堅牢なパラメーターを使用して複雑な分析を実行できます。 分析が実行されると、生成されたレポートはバイオインフォマティシャンによってレビューされ、その後でのみ他の協力者または顧客と共有されます。

これにより、あらゆる段階でのコラボレーションとデータの制御が保証されます。 それは全員にとっての勝利です。

すでにBasepairを利用しているバイオインフォマティクスコア

6サンプル フリートライアル 実施中

最大6つのサンプルを無料でアップロードして分析できます。アップロードされたサンプルに対する解析は無制限です。世界トップクラスの機関、研究室、製薬チームがBasepairを使用して、数千ドルを節約している理由をご覧ください。