-
TechBlog
BasepairでのDESeq2パイプライン
DESeq2パイプラインが実行されると、最初にExpression count（STAR）パイプラインが自動的に実行されます。DESeq2パイプラインはSTARパイプラインで生成された遺伝子カウントマトリックスを使用しま […] -
TechBlog
Reactomeパスウェイエンリッチメント解析のアウトプットファイル
「DESeq2」パイプラインによって生成された全てのアウトプットファイルは「Input/output」タブ（赤枠 1）にあります。Reactome のパスウェイエンリッチメント結果は、「pathway […] -
TechBlog
Reactomeパスウェイエンリッチメント解析からアウトプットされたGSEAレポート
DESeq2パイプラインでパスウェイエンリッチメント解析を実行するとGSEAレポートが作成されます。このレポートはzipフォルダ（図1の青枠）にあります。このフォルダは「Input/output」タブ（図1の赤枠）からア […] -
TechBlog
Basepairでパスウェイ解析（Reactome）
パスウェイ解析とは Basepairではパスウェイ解析も行うことができます。あらかじめ定義された遺伝子や遺伝子産物の位置、遺伝子同士の相互作用などの情報を含んだモデルをもとに行うため、より生物学的な議論を行う […]
