-
TechBlog
SAMtoolsとSambambaの比較： どちらのツールがBAMファイルをより速くソートできる？
NGSアライメントツールの性能は継続的に向上していますが、アライメントデータをソートするのにアライメントよりも多くの時間を要するようになりました。最近、SAMtoolsバージョン1.xでソートの並列処理がサポートされ、ソ […] -
TechBlog
Basepairの誕生秘話
Basepairは2008年に設立されました。BasepairのCEOであるAmit Sinhaが、ハーバード大学医学部やその他の研究機関に勤務していた際に、次世代シーケンス（NGS）解析の際に彼が個人的に直面していた課 […] -
CaseStudy
Nkarta Therapeutics：バイオインフォマティシャンにスーパーパワーを
バイオインフォマティシャンにとって時間はすべてです。活発な研究開発グループが分析が必要な新しいデータセットを常に作成しているため、その要求に応え続けることは困難な戦いです。バイオインフォマティクス部門のアソシエートディレ […] -
Bioinformatics
ATAC-Seq解析とパイプラインの概要
ATAC-seq解析 Assay for Transposase-Accessible Chromatin (一般的に ATAC-seq と呼ばれます) は、トランスポザーゼに依存してゲノム レベルでクロマチンのアクセス […] -
CaseStudy
Yale 大学：シーケンスコアよりも高速 〜Basepairを使用してカスタムNGSパネルで150サンプルを分析した方法〜
生物医学エンジニアのRachael Putmanさんは昨年学士号を取得したが、それでもこの若い科学者はイェール大学のグレイザー研究所の一員として最先端の研究を追求することを止めなかった。 Putman氏の研究は、マウス胚 […] -
Announcements
プレスリリース: バイオサイエンスとベースペアをスケールして単一細胞シーケンシングデータ解析を民主化
著 ローハン シャルマ | 2023 年 8 月 21 日 | ニュース 2023 年 8 月 21 日 09:00 AM 東部夏時間 サンディエゴ – 単一細胞シーケンシング技術のパイオニアである Scale Bios […] -
TechBlog
NGSデータの品質管理と前処理のベストプラクティス：研究者向けガイド
学術研究者として、私たちは次世代シーケンス (NGS) データの分析が複雑で時間がかかる可能性があることを知っています。 NGSデータの品質は下流の分析の精度に直接影響するため、最初から高品質のデータを確実に生成すること […] -
CaseStudy
Memorial Sloan Kettering Cancer Center（MSKCC）：200のNGSデータをコードを書かずに分析した方法
Memorial Sloan Kettering Cancer Center（メモリアル・スローン・ケタリングがんセンター、MSKCC）のDr. Omar Abdel-Wahabが、ASXL2（AML1-ETO融合腫瘍タ […] -
CaseStudy
EpiCypher：BasepairのカスタムNGS分析ソリューションを使用してアッセイ開発をどのように加速したか
場合によっては、一般的なNGS分析パイプラインでは十分ではなく、チームがカスタムソリューションを必要とすることがあります。 EpiCypherは、エピジェネティック生物学およびクロマチン生物学の最先端技術を開発するバイオ […] -
TechBlog
Basepairを使うと、リモートでできることが広がる
多くの企業や大学が新型コロナウイルス感染症の感染拡大を抑制するために広範な対策を講じており、多くの従業員が現在リモートで勤務しています。 さまざまなソフトウェアツールを使用すると、リモートチームがメッセージ、会議、プロジ […]
