クラスタリング

Integrateパイプラインは、異なるシングルセルRNA-seqサンプルを比較するために使用します。ここでは、シングルセルRNA-seqパイプラインで生成された各サンプルのSeurat Objectをインプットとして使 […]

シングルセルRNA-seqパイプラインではfastpを用いてQCとトリミングを行います。まず、UMI-toolsを用いてバーコードとユニーク分子識別子（UMI）を抽出します。次に、STARを用いてアライメントを行います。 […]

scRNA-seq データを分析する最初のステップは、実験の背後にある生物学を理解することです。 scRNA-seq は各細胞の遺伝子発現データを生成します。このデータは、細胞の種類を特定し、細胞の状態を特徴付け、遺伝子 […]