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Bioinformatics
なぜインタラクティブレポートなのか？
RNA-Seqのデータ解析は、エクセルやRと格闘したり、受注会社に依頼したりすることが多いと思います。これには、時間とコストがかかります。インタラクティブレポートを使うと、大きく時間をコストを圧縮することができます。 R […] -
TechBlog
FASTQファイルの品質評価と前処理
なぜFASTQの品質が重要か FASTQの品質は、下流の解析の品質に影響します。 FASTQデータには、低品質リードが含まれることがあります。多くの場合、これはシーケンシングエラーやPCRバイアスなどの要因によって生じま […] -
TechBlog
SAMtoolsとSambambaの比較： どちらのツールがBAMファイルをより速くソートできる？
NGSアライメントツールの性能は継続的に向上していますが、アライメントデータをソートするのにアライメントよりも多くの時間を要するようになりました。最近、SAMtoolsバージョン1.xでソートの並列処理がサポートされ、ソ […]
