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FASTQファイルの品質評価と前処理
なぜFASTQの品質が重要か FASTQの品質は、下流の解析の品質に影響します。 FASTQデータには、低品質リードが含まれることがあります。多くの場合、これはシーケンシングエラーやPCRバイアスなどの要因によって生じま […] -
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Basepairのアップロードページで複数のサンプルをシームレスに追加
FASTQファイルは単なるファイルでも、単なるデータでもありません。FASTQファイルは、実験、ライブラリー調製、シーケンスなどに費やした数え切れないほどの時間の集大成です。データを収集するのに費やした時間は、おそらくあ […] -
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.bed、.bam、その他のファイルフォーマット
人々をバイオインフォマティクスから遠ざける要因の中で、様々な入力と出力のファイルタイプがたくさんあることが、大きな要因の一つあることは間違いません。 ngsplotを使ってヒートマップを作成するには、bamファイルが必要 […]
