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ATAC-seq 解析ではシングルエンドリードのみを使用していますが、データをレスキューできますか?
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さらに分析するには、特定のインサートサイズのリードをフィルタリングする必要がありますか?
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ATAC-seqデータではどのような品質管理指標が重要ですか?
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カバレッジと読み取り深度の違いは何ですか?？ATAC-seq データには何回の読み取りが必要ですか？
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ATAC-seq データの期待される重複率はどれくらいですか?
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ATAC-seqのペアエンドデータは必要ですか？
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ミトコンドリア DNA は ATAC-seq データのノイズの原因になりますか? どのように対処すればよいでしょうか?
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ATAC-seq アライメントインサートのサイズに傾向が見られますか?
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FRIP スコアはどの程度が良いと考えられますか?
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サンプルのリード数が異なる場合、それらのピークをまとめて呼び出すことができますか?
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ATAC-seq データの推奨ピーク設定 (広いか狭いか) は何ですか?
