ATAC-seq アライメントインサートのサイズに傾向が見られますか?

はい。 DNA は、約 147 塩基対の周期でヒストンを包み込みます。 これに、Tn5 酵素の結合に必要な塩基対を追加する必要があります。これにより、フラグメントが 160 ～ 300 bp の間の範囲に増加します。

インサートのサイズとその存在量を視覚化すると、クロマチンのない DNA を示す約 50 ～ 100 bp の鋭い初期ピークに気づき、その後、およそ 200 bp ごとにいくつかの短いピークがあり、単一、二重、三重のヌクレオソーム複合体を示します。