さらに分析するには、特定のインサートサイズのリードをフィルタリングする必要がありますか?

短いフラグメント (< 100 bp) はクロマチンのない領域を表すため、保持する必要があります。 これらは、転写因子 (TF) やポリメラーゼ複合体にアクセスできるため、活発に転写される可能性が最も高い領域です。

より大きなフラグメントは、約 200 塩基対の周期で出現することもあり、モノヌクレオソーム、ジヌクレオソーム、トリヌクレオソームを示します。 これらは除外したり、ヌクレオソームの位置を推測するために使用したりできます。 より大きなフラグメントは、ヒストン間の開いたクロマチン領域を真に表すものではないため、除外されます。