Expression Count レポートにおける適切な一致率はどれくらいですか?

Expression Count レポートにおける適切な一致率はどれくらいですか?

アライメント率が「良好」とみなせるかどうかは、サンプルに使用されるソースとライブラリ調整キットに依存するため、ハードカットオフを割り当てるのは難しい場合があります。 そうは言っても、アライメントが 70% 未満のサンプルは、さらに詳しく調べた方がよいかもしれません。

多くの場合、アライメントされたリードのパーセンテージよりも、最終的にアライメントされたリードの数の方が重要であることに留意してください。 ゲノムに合わせたリード数が少ないと、下流の結果の妥当性が疑問視される可能性があります。

A Sankey diagram in the Expression Count (STAR) pipeline provides sample alignment metrics.