Basepair のシングルセルパイプラインではどのようなツールを使用していますか?

BasepairのシングルセルRNA-seq パイプラインは以下を使用します。

1. バーコードを抽出するための UMI ツール
2. 位置調整用の STAR ツール
3. QCのためのfastp
4. クラスタリングと視覚化のための Seurat

すべてのパイプラインは、引用度の高い、査読済みのツールを使用して構築されています。 さらに、公開されているデータセットを使用してすべてのパイプラインを検証します。 シングルセルパイプラインをどのように検証したかについて詳しくは、 こちらを ご覧ください。