技術的なばらつきをどのように考慮していますか?プログラムは平均分散傾向、非ゼロの生物学的変動のテスト、またはデコンボリューションベースの正規化に適合していますか?

遺伝子発現はまず各細胞内の総発現を考慮して正規化され、次に対数変換が適用されます。 下流の教師なし解析 (PCA、t-SNE など) 用の遺伝子を選択するには、分散安定化変換 (VST) を使用して発現値の不均一分散性を補正します。 また、総 UMI 数、検出された総遺伝子、ミトコンドリアにマッピングされている読み取りの割合の細胞ごとの測定値を回帰する方法も適用します。