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Nkarta Therapeutics：バイオインフォマティシャンにスーパーパワーを
バイオインフォマティシャンにとって時間はすべてです。活発な研究開発グループが分析が必要な新しいデータセットを常に作成しているため、その要求に応え続けることは困難な戦いです。バイオインフォマティクス部門のアソシエートディレ […] -
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ATAC-Seq解析とパイプラインの概要
ATAC-seq解析 Assay for Transposase-Accessible Chromatin (一般的に ATAC-seq と呼ばれます) は、トランスポザーゼに依存してゲノム レベルでクロマチンのアクセス […] -
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Yale 大学：シーケンスコアよりも高速 〜Basepairを使用してカスタムNGSパネルで150サンプルを分析した方法〜
生物医学エンジニアのRachael Putmanさんは昨年学士号を取得したが、それでもこの若い科学者はイェール大学のグレイザー研究所の一員として最先端の研究を追求することを止めなかった。 Putman氏の研究は、マウス胚 […] -
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NGSデータの品質管理と前処理のベストプラクティス：研究者向けガイド
学術研究者として、私たちは次世代シーケンス (NGS) データの分析が複雑で時間がかかる可能性があることを知っています。 NGSデータの品質は下流の分析の精度に直接影響するため、最初から高品質のデータを確実に生成すること […] -
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Memorial Sloan Kettering Cancer Center（MSKCC）：200のNGSデータをコードを書かずに分析した方法
Memorial Sloan Kettering Cancer Center（メモリアル・スローン・ケタリングがんセンター、MSKCC）のDr. Omar Abdel-Wahabが、ASXL2（AML1-ETO融合腫瘍タ […] -
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EpiCypher：BasepairのカスタムNGS分析ソリューションを使用してアッセイ開発をどのように加速したか
場合によっては、一般的なNGS分析パイプラインでは十分ではなく、チームがカスタムソリューションを必要とすることがあります。 EpiCypherは、エピジェネティック生物学およびクロマチン生物学の最先端技術を開発するバイオ […] -
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Basepairを使うと、リモートでできることが広がる
多くの企業や大学が新型コロナウイルス感染症の感染拡大を抑制するために広範な対策を講じており、多くの従業員が現在リモートで勤務しています。 さまざまなソフトウェアツールを使用すると、リモートチームがメッセージ、会議、プロジ […] -
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Basepairを使用したNGS結果の視覚化
作家は文章を書き、画家は絵を描き、ゲノミクス研究者は…バイオインフォマティクスパイプラインがNGSデータの処理を完了するまで辛抱強く待っているのに、結果の視覚化に同じくらいの時間を費やすだけでしょうか? 長年、研究者およ […] -
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シングルセルRNA-Seqデータを分析するための包括的なガイド
scRNA-seq データを分析する最初のステップは、実験の背後にある生物学を理解することです。 scRNA-seq は各細胞の遺伝子発現データを生成します。このデータは、細胞の種類を特定し、細胞の状態を特徴付け、遺伝子 […] -
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Basepair APIの機能
より専門的なユーザーが懸念しているのは、仲間のバイオインフォマティシャンや研究所の所長から聞いたこんな話のような状況です。「真夜中に寝ぼけ眼で起きてNGSデータ分析パイプラインの結果を確認し、ファイルを別のファイルに変換 […]
