ヒストン修飾と転写因子の分析を行う際に、デフォルト設定の変更を推奨しますか?

注目するタンパク質の種類と修飾によって、狭いピークと広いピークなど、さまざまな種類のピークが生じる可能性があります。 転写因子は狭いピークになる傾向があり、これがピーク呼び出しパイプラインのデフォルト設定です。 特定の種類のヒストン修飾は、より広い、または分散したピークになる場合があります。

ヒストン修飾を調べている場合は、ピーク コーリング解析を実行する前に、MACS2 のブロード ピーク パラメーターを「True」に設定する必要があります。