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BasepairでのATAC-seq Peaks, Motif (MACS2)パイプライン
このパイプラインを実行すると、最初に「ATAC-seq alignment (Bowtie2)」パイプラインが自動的に実行されます。その次に実行されるMACS2パイプラインでは、「ATAC-seq alignment ( […] -
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Basepairでのエピジェネティクスデータのモチーフ検出とアノテーション
はじめに モチーフ検出とは、繰り返し現れる短いDNA配列を検出することです。エピジェネティクスでは、転写因子や他の制御タンパク質の結合部位を表します。 モチーフの検出はピークコーリングの後に行われます(図1)。ピークコー […]
