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Differential Expression(DE-Seq)インタラクティブプロットの作成
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データの分析はすでに完了しており、リードカウントの発現マトリックスが得られています。さらに分析するためにそのデータを Basepair にアップロードできますか?
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RNA-Seqの結果
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GSEA 分析で一連の遺伝子が正の相関関係にある場合と負の相関関係にある場合、それは何を意味しますか?正の相関があるということは、それらの遺伝子がサンプル中で上方制御されていることを意味しますか?
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RNA-seq 解析のデフォルトのトリミング設定はどこで変更できますか?
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Wald検定と尤度比検定(LRT)の違いは何ですか? どちらが好ましいですか?
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PCAプロットに外れ値サンプルのように見えるものが表示されます。どうすればいいですか?サンプルを分析から除外する必要がありますか?
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差次的発現(differential expression)レポートでは、P-value(P値)と P-adjusted value(P調整値)のどちらの指標がより重要ですか?
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エンリッチされたGSEAプロットとエンリッチされていないGSEAプロットの違いはどのようにして見分けることができますか?
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Expression Count レポートにおける適切な一致率はどれくらいですか?
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良い品質スコアとは何ですか?
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トリミング、アライメント、発現定量と差次発現分析
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RNA-Seqのノーマライゼーションとヒートマップの作成