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BasepairでのDe-novo assembly (Trinity)パイプライン
De-novo assembly（Trinity）パイプラインは、リファレンスゲノムなしで全長の転写産物を再構築するために使用されます。このパイプラインでは、まず品質管理と低品質リードのトリミングを行います。次に、短いR […] -
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Basepair でのDNA-seq QC, Alignment (BWA) パイプライン
このパイプラインではDNA-seqのFASTQデータの前処理を行います。まず、品質評価と低品質データのトリミング、そしてアライメントを行います。次に重複リードを除去します。最後にゲノムカバレッジを計算します。 パイプライ […] -
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NGSデータの品質管理と前処理のベストプラクティス：研究者向けガイド
学術研究者として、私たちは次世代シーケンス (NGS) データの分析が複雑で時間がかかる可能性があることを知っています。 NGSデータの品質は下流の分析の精度に直接影響するため、最初から高品質のデータを確実に生成すること […]
