MACS2

「CUT&Tag Peaks, Motif (MACS2, Homer)」パイプラインを実行すると、「CUT&Tag QC, Alignment (Bowtie2)」パイプラインが自動的に最初に実行されま […]

「CUT&RUN Peaks, Motif (MACS2)」パイプラインを実行すると、まず「CUT&RUN QC, Alignment (Bowtie2)」パイプラインが自動的に最初に実行されます。「CU […]

このパイプラインを実行すると、最初に「ATAC-seq alignment (Bowtie2)」パイプラインが自動的に実行されます。その次に実行されるMACS2パイプラインでは、「ATAC-seq alignment ( […]

はじめに モチーフ検出とは、繰り返し現れる短いDNA配列を検出することです。エピジェネティクスでは、転写因子や他の制御タンパク質の結合部位を表します。 モチーフの検出はピークコーリングの後に行われます（図1）。ピークコー […]

ATAC-seq解析 Assay for Transposase-Accessible Chromatin (一般的に ATAC-seq と呼ばれます) は、トランスポザーゼに依存してゲノム レベルでクロマチンのアクセス […]

作家は文章を書き、画家は絵を描き、ゲノミクス研究者は…バイオインフォマティクスパイプラインがNGSデータの処理を完了するまで辛抱強く待っているのに、結果の視覚化に同じくらいの時間を費やすだけでしょうか? 長年、研究者およ […]