オールインワンRNA-Seq

抽出RNAをお送りいただくだけ
解析は自分でブラウザ上で
できるオールインワンRNA-Seq

プログラミングの学習コストが高い…

簡単な部分は自分でやりたい…

手元のPCではスペックが足りない…

RNA-Seqは最も多く選択されるNGS（次世代シーケンサー）アプリケーションの一つです。細胞に発現するRNAを網羅的に解析することができます。とはいえ、NGSから出力される生データは膨大なデータ量になります。そのため、解析にはPC環境を用意したり、プログラミングを勉強したりする必要があります。あるいは、共同研究者に依頼したり、専門の業者に委託することもできます。

オールインワンRNA-Seqは、NGSから出力されたfastqをクラウドにてお届けします。

結果は、インタラクティブなレポートとして表示され、フィルタリングやソーティングは自分で行うことができます。各種プロットやテーブルは、PNG、SVG、CSVなどでダウンロードすることができます。各種パラメーターも調整することができ、条件を変えた解析は何度でも自分で行うことができます。

価格

49,800円/サンプル

※ 消費税別。ボリュームディスカウントもありますので、お問合せください。

サービス概要

• 生物種 ：ヒト・マウス
• 受入サンプル ：抽出RNA（凍結・1.5mlのエッペンチューブ）
• データ量 ：6Gb
• 納品物：サンプルQC報告書、クラウドデータツールによるデータ納品と解析結果※
• サンプル要件 ：

ボリューム	濃度	OD260/280	RIN値	28S/18S
total RNA 1μg	50ng/μL	1.8〜2.0	7以上	2.0以上

※ 2群比較（1比較）を実行済みにてURLをお送りします。2比較以上は手順書を元にご自身で行っていただきます。その他解析については、オプションにて承ります。各種解析も承っておりますので、お気軽にお問い合わせください。

データ解析ツール

fastqcから発現カウント、発現変動解析、エンリッチメント解析まで自分で行うことができます。

GUIで簡単解析

グラフィカルユーザーインターフェースで、データ解析を行うことができます。ソーティングやフィルタリングも可能。
プロットやテーブルは、PNG、SVG、CSVなどでダウンロード可能で、下流の解析に活用できます。

解析環境準備不要

解析はクラウド上で行われますので、手元のPCのスペックは問いません。インターネット環境があれば、どこからでも解析可能です。

豊富な解析項目

データQC（fastqc）、発現カウント（STAR）をはじめ、発現変動解析（DESeq2）には、ボルケーノプロット、PCA、相関プロット、エンリッチメント解析（GSEA GO・Pathway）が含まれています。

その他オプション

• RNA抽出：5,000円/サンプル（税別）
• 実験計画〜アフターフォロー：40,000円/1比較（税別、ボリュームディスカウントあり）
• depletionキットへの変更：10,000円（税別）

サンプル送付先

お問い合わせ