複数のファイルを含むサンプルを Basepair にアップロードする方法
複数のファイルを含むサンプルをアップロードするにはどうすればよいですか?
場合によっては、シーケンスからデータを取得すると、1 つのサンプルが複数の fastq ファイルに関連付けられていることがわかります。 これはまったく問題ありません。ただ、シーケンス サービス プロバイダーがシーケンス データをどのように送信するかによって異なります。
例を見て、複数のファイルを含むサンプルを Basepair にアップロードする方法を見てみましょう。
さて、それでは、コンピューターからアップロードしたいファイルを選択しましょう。 これらのファイルは標準の命名規則に従っているため、Basepair はこここでは、サンプル 1 と呼ぶサンプル用に 6 つのファイルがあります。これらのファイルはすべて 1 つのサンプルのサブセットです。つまり、3 つの順方向読み取りファイルと 3 つの逆方向読み取りファイルがありますが、それらはすべてサンプル 1 の一部です。 . なお、R1 は順方向読み出しファイル、R2 は逆方向読み出しファイルを示します。
これらのファイルを自動的に正しく並べ替えるようになりました。 ただし、ファイルが実際に正しく並べ替えられていることを常に再確認する必要があります。 並べ替えが間違っている場合は、ファイルを適切なセクションにドラッグ アンド ドロップするだけです。
最後に、サンプルの正しいメタデータを選択し、[アップロード] をクリックしてアップロード プロセスを開始します。
よくある間違い
- 複数の FASTQ ファイルを別々のサンプルに分割する
- これらを 1 つのサンプル セクションにドラッグ アンド ドロップしてください。
- 技術的な複製を単一のサンプルとして扱う
- 複数のファイルを Basepair にアップロードするときは、それらのファイルが実際に 1 つのサンプルの一部であり、たとえば 2 つまたは 3 つの別個の技術的複製ではないことを確認してください。 複製があり、それらのファイルを 1 つのサンプルの一部としてアップロードした場合、それらのファイルはすべてソフトウェアによって 1 つのサンプルとして扱われ、結合されます。 これにより、不正確な分析結果が得られます。