Features

Basepairは、簡単で使いやすいだけではありません。バックエンドは堅牢に構築されており、セキュリティを担保しつつ、拡張性を提供します。また、カスタマイズのご要望もお受けしております。自社で構築する必要があるもののコスト・時間などリソースのために、実現していないアイデアやプロジェクトがあれば、是非ご相談ください。

キャパシティ

Basepairは、多くのリクエストを遅滞なく進められるよう構築されています。

高速アルゴリズム

アルゴリズムの多くは、並列実行するように最適化されており、サンプルが10個でも10,000個でも解析時間は変わりません。RNA-Seqであれば30分程度、シングルセルRNA-Seqでも数時間で結果が得られます。結果を迅速に得るために、最大32コア、SSDディスク、強化されたネットワークを備えたサーバーを使用しています。

スケーラビリティ

Basepair は、大規模なゲノムプロジェクトのワークロードを処理できるよう構築されています。Basepairのスケールアウト アーキテクチャは、ユーザーが新しい分析を要求するとサーバーを起動し、分析が完了するとサーバーを自動的にシャットダウンします。 当社には、最大のワークロードをサポートするために数千台のマルチコアサーバーを実行する能力があります。

無制限のストレージ

高度な機能を持つAWS上で実行され、安全で暗号化され、耐久性のある事実上無制限のストレージをユーザーに提供します。 生データ、中間ファイル、最終結果を自動的に保存します。 Basepair は Web ベースであるため、インターネット アクセスがあれば世界中のどこからでもデータを利用できます。

カスタマイズ

Basepairは見た目はシンプルですが、コマンドラインからの利用や自動化にも対応しています。また、パイプラインの統合も可能です。

カスタマイズについて

パイプライン

BasepairではすでにGATKやBowtie、MACS2、seuratなど主要なパイプラインは実装済みですが、ご要望があれば、是非お知らせください。Basepairはユーザーの声を大事にしております。これまでもご要望の多かったものから順次追加しています。お急ぎの場合は別料金でも対応可能です。nf-coreやWDLにも対応しており、独自のワークフローを組み込みたいなどのご要望にも対応しております（Professional/Enterpriseライセンス）。

自動化

GUIはわかりやすく視認性が高いのがメリットですが、大量のサンプルを処理するとなるとかえって煩雑になってしまいます。そこでBasepairは、APIを実装しています。Terminal（Mac）などからCLIを用いて、Basepairをコントロールすることができます。

[自動化について]

“Connected Cloud” （自社クラウドとの接続）

すでにAWSなどクラウドを利用している、あるいは今後クラウドの利用を検討されている場合は、Basepairを連携させることができます（Professional/Enterpriseライセンス）。これを”Connected Cloud”と読んでいますが、これにより、ユーザー認証やインターフェースなど構築が煩雑な部分でBasepairを使うことで迅速なサービスインが可能になります。また、ストレージ（S3）やコンピューティング（EC2）は自社のクラウドを活用することができるため、コスト効率を向上させることができます。

[アーキテクチャー]

[AWS での NGS データ分析の操作: シーケンシングを初めて行うライフ サイエンス組織のための重要な考慮事項]

ホワイトラベル

Professional/Enterpriseライセンスでは、ホワイトラベルのオプションがあります。ホワイトラベルとは、Basepairのブランド（ロゴなど）を消して、自社ブランドとしてBasepairを利用することができる機能で、自社のユーザーに対して自社ブランドとしてBasepairを提供することができます。

セキュリティとデータガバナンス

Basepairが稼働しているAWSは、HIPAAなど高度なセキュリティ・プライバシーポリシーに準拠しており、BasepairもHIPAA・GDPRの要求仕様を満たすか、それを超える設計がなされています。

[セキュリティとデータガバナンスについて]

暗号化

当社は業界標準を満たしているかそれを上回り、悪意のあるエージェントからデータを保護します。 当社の Web インターフェイスとAPIは両方とも httpsのみであり、お客様のコンピュータと当社のサーバー間のすべての情報が暗号化されます。 すべてのデータは保管中に暗号化されます。 当社のサーバーは安全なファイアウォールの内側で動作します。

プライバシー

私たちはあなたのデータが非常に貴重であることを理解しています。 誰が自分のデータにアクセスできるかを完全に制御できます。あなたまたはデータの表示または編集を明示的に許可したBasepair上の他のユーザーのみがアクセスできます。

監視

大規模なプロジェクトでは、複数の関係者がデータを表示、追加、編集します。 Basepairはすべてのアクティビティを追跡するため、誰がいつ何をしたかを常に把握できます。 すべてのユーザーアクティビティは体系的に保存され、レビューに利用できます。 多くの場合、必要に応じて変更をロールバックできます。

SLA（Service Level Agreement）

ユーザーは重要なプロジェクトに関してBasepairを信頼してご利用いただいており、その責任を非常に真剣に受け止めています。Basepairアーキテクチャは、堅牢かつフォールトトレラントになるように設計されています。 当社は 99.9% の可用性を提供するよう努めており、過去 12 か月間で 99.8%、過去 30 日間で 100% 完全に機能していました。