Basepairでの新しい解析の始め方

Basepairでの新しい解析の始め方

新しい分析を実行するには、分析するサンプルがアップロードされていることを確認してください。 その方法がわからない場合は、Basepair にサンプルを追加する方法に関する以前のチュートリアルを参照してください。

  1. 上部の分析タブにマウスを移動し、「New Analysis」をクリックします。
  2. 実行するパイプラインを選択します。
  3. 分析したいサンプルを選択します。
  4. 必要に応じて、分析名を自由に変更してください。
  5. (オプション) 上級ユーザーで分析パラメータをカスタマイズしたい場合は、「change default options」をクリックしてカスタマイズできます。
  6. 最後に、「run analysis」をクリックします。

分析の実行にかかる時間はパイプラインによって異なりますが、発現差分析の場合は30分〜、シングルセルRNA-seq分析の場合は数時間かかる場合があります。

複数の分析を同時に実行している場合でも、オンデマンドでサーバーが起動され、すべての分析が並行して実行されるため、Basepairでの分析の実行にかかる時間は増加しません。