シングルセルもコーディングなしで
Basepairは、わずか数回のクリックで、データのアップロードからインタラクティブな視覚化によるデータ探索までを行うことができます。バイオインフォマティクスやコーディングの経験は必要ありません。 データはブラウザ上に表示され、インタラクティブにデータ解析が可能です。
Basepairではじめよう
専用マシンもインストール不要のNGSデータ解析クラウドサービス
BasepairはSaaSです。専用マシンやソフトウェアのインストールは不要です。マシンやPCのスペックを検討したり、たくさんのソフトウェア、プログラムをインストールする際に、バージョンや依存関係の確認なども必要ありません。内部プログラムは実績のあるパブリックなもので構成。論文も多数出版されています。
生データをアップロードしてパイプラインを選ぶだけ
サンプルデータは、FASTQなど生データをアップロードできるほか、Basespaceからの転送、GEO/NCBIからの転送、FTPへの接続にも対応しています。複数のサンプルをアップロードする場合は、APIを使ったコマンドラインでの操作（CLI）にも対応しています。多くのパイプラインはシーケンサーに関係なく解析可能です。
サンプルあたりの従量課金ー初期費用・解析追加料金なし
課金はサンプル数のみに依存する従量制です。アップロードされたサンプルに対する解析は無制限・追加課金ありません。また、初期費用も不要です。
※ 多量のサンプルを取り扱う場合は、年間ライセンスもご用意しています。
シングルセルRNA-Seq可視化ツール
BasepairのscRNA-seqパイプラインは、高速で利用可能な最高のピアレビュー済みツールに基づいて構築されています。 アライメント、発現の定量化からクラスタリング、視覚化に至るまで、パイプラインのすべてのステップは完全に自動化されています。 さらに、シングルセルRNA-seq解析にとってレポートとビジュアルがいかに重要であるか、そしてそのセットアップがどれほど面倒であるかを私たちは理解しています。 そのため、パイプラインを実行するたびに生成される対話型レポートの一部として、豊富なビジュアルおよび対話型コンポーネントが組み込まれています。
Basepairは、査読ジャーナルにも使われています。
6サンプル フリートライアル 実施中
最大6つのサンプルを無料でアップロードして分析できます。アップロードされたサンプルに対する解析は無制限です。世界トップクラスの機関、研究室、製薬チームがBasepairを使用して、数千ドルを節約している理由をご覧ください。