コーディングなしでできるRNA-Seqデータ解析

RNA-Seqのデータ解析をコーディングなしで

Basepairは、わずか数回のクリックで、データのアップロードからインタラクティブな視覚化によるデータ探索までを行うことができます。バイオインフォマティクスやコーディングの経験は必要ありません。 データはブラウザ上に表示され、インタラクティブにデータ解析が可能です。

RNA-Seq(gifアニメーション)

Basepairではじめよう

多様なRNA-Seq視覚化ツール

Basepairで使用されているSTAR、DESeq2、Tophat、Cufflinks などのRNA-seqツールは、業界標準のパブリックドメインのアルゴリズムであり、多くの引用と査読が行われています。各種プロットは、PNG、SVGで、各種テーブルはCSVでのダウンロードが可能です。その他の中間ファイルなどもダウンロード可能です。

また、すべてのRNA-Seqレポートには、データの品質の概要を示すQC チャートが含まれています。 最高品質の出力を保証するために、Basepair は生データをチェックし、品質評価を割り当てます。

BasepairのRNA-Seqパイプラインでできること

  • 2グループ以上のグループ間の比較
  • ボルケーノプロット、PCA、GESA(エンリッチメント解析、GO/Pathway)
  • 遺伝子の絞り込み(プロット上、テーブル上)
  • 絞り込みデータのダウンロード

使いたい機能がない場合は、随時追加しておりますので、ご要望をお知らせください。

カウント分布ヒストグラム
発現変動遺伝子解析ボルケーノプロットRNASeq
ゲノムブラウザー

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Basepairは、査読ジャーナルにも使われています。

“Fast, excellent and reasonably priced…you CAN get all three!! Thank you to the folks at Basepair for helping us deal with some difficult RNA Seq data.”

Sharen Mckay
Yale University
“I really like how easy the website is to use. And how quickly the results are generated, including figures. I would have never thought about doing a new analysis like I just did.”

Emilie Montenont
NYU Langone Health
“Support answers come fast and are always precise!”

Maria Hollnagel
Ulm University

6サンプル フリートライアル 実施中

最大6つのサンプルを無料でアップロードして分析できます。アップロードされたサンプルに対する解析は無制限です。世界トップクラスの機関、研究室、製薬チームがBasepairを使用して、数千ドルを節約している理由をご覧ください。