RNA-Seqのデータ解析をコーディングなしで
Basepairは、わずか数回のクリックで、データのアップロードからインタラクティブな視覚化によるデータ探索までを行うことができます。バイオインフォマティクスやコーディングの経験は必要ありません。 データはブラウザ上に表示され、インタラクティブにデータ解析が可能です。
Basepairではじめよう
専用マシンもインストール不要のNGSデータ解析クラウドサービス
BasepairはSaaSです。専用マシンやソフトウェアのインストールは不要です。マシンやPCのスペックを検討したり、たくさんのソフトウェア、プログラムをインストールする際に、バージョンや依存関係の確認なども必要ありません。内部プログラムは実績のあるパブリックなもので構成されています。
生データをアップロードしてパイプラインを選ぶだけ
サンプルデータは、FASTQなど生データをアップロードできるほか、Basespaceからの転送、GEO/NCBIからの転送、FTPへの接続にも対応しています。複数のサンプルをアップロードする場合は、APIを使ったコマンドラインでの操作（CLI）にも対応しています。多くのパイプラインはシーケンサーに関係なく解析可能です。
サンプルあたりの従量課金ー初期費用・解析追加料金なし
課金はサンプル数のみに依存する従量制です。アップロードされたサンプルに対する解析は無制限・追加課金ありません。また、初期費用も不要です。
※ 多量のサンプルを取り扱う場合は、年間ライセンスもご用意しています。
多様なRNA-Seq視覚化ツール
Basepairで使用されているSTAR、DESeq2、Tophat、Cufflinks などのRNA-seqツールは、業界標準のパブリックドメインのアルゴリズムであり、多くの引用と査読が行われています。各種プロットは、PNG、SVGで、各種テーブルはCSVでのダウンロードが可能です。その他の中間ファイルなどもダウンロード可能です。
また、すべてのRNA-Seqレポートには、データの品質の概要を示すQC チャートが含まれています。 最高品質の出力を保証するために、Basepair は生データをチェックし、品質評価を割り当てます。
BasepairのRNA-Seqパイプラインでできること
- 2グループ以上のグループ間の比較
- ボルケーノプロット、PCA、GESA（エンリッチメント解析、GO/Pathway）
- 遺伝子の絞り込み（プロット上、テーブル上）
- 絞り込みデータのダウンロード
使いたい機能がない場合は、随時追加しておりますので、ご要望をお知らせください。
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Basepairは、査読ジャーナルにも使われています。
最大6サンプル フリートライアル 実施中
最大6つのサンプルを無料でアップロードして分析できます。アップロードされたサンプルに対する解析は無制限です。世界トップクラスの機関、研究室、製薬チームがBasepairを使用して、数千ドルを節約している理由をご覧ください。